Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO1Q12778 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXO1Q12778 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO1Q12778 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXO1Q12778 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO1Q12778 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO1Q12778 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO1Q12778 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO1Q12778 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXO1Q12778 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO1Q12778 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO1Q12778 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO1Q12778 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO1Q12778 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO1Q12778 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO1Q12778 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXO1Q12778 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO1Q12778 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO1Q12778 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO1Q12778 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO1Q12778 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO1Q12778 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO1Q12778 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO1Q12778 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXO1Q12778 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXO1Q12778 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXO1Q12778 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXO1Q12778 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXO1Q12778 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXO1Q12778 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXO1Q12778 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXO1Q12778 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXO1Q12778 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXO1Q12778 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXO1Q12778 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXO1Q12778 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXO1Q12778 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXO1Q12778 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXO1Q12778 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXO1Q12778 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXO1Q12778 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXO1Q12778 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXO1Q12778 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXO1Q12778 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXO1Q12778 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXO1Q12778 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXO1Q12778 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXO1Q12778 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXO1Q12778 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXO1Q12778 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXO1Q12778 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXO1Q12778 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXO1Q12778 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXO1Q12778 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXO1Q12778 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXO1Q12778 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXO1Q12778 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXO1Q12778 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXO1Q12778 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXO1Q12778 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXO1Q12778 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXO1Q12778 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXO1Q12778 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXO1Q12778 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXO1Q12778 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXO1Q12778 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXO1Q12778 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXO1Q12778 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXO1Q12778 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXO1Q12778 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXO1Q12778 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXO1Q12778 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXO1Q12778 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO1Q12778 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO1Q12778 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO1Q12778 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO1Q12778 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXO1Q12778 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO1Q12778 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO1Q12778 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO1Q12778 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO1Q12778 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO1Q12778 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO1Q12778 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO1Q12778 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXO1Q12778 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO1Q12778 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXO1Q12778 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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