Protein–RNA interactions for Protein: Q08ER8

ZNF543, Zinc finger protein 543, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF543Q08ER8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF543Q08ER8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF543Q08ER8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF543Q08ER8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF543Q08ER8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF543Q08ER8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF543Q08ER8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF543Q08ER8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF543Q08ER8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF543Q08ER8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF543Q08ER8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF543Q08ER8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF543Q08ER8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF543Q08ER8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF543Q08ER8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF543Q08ER8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF543Q08ER8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF543Q08ER8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF543Q08ER8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF543Q08ER8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF543Q08ER8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF543Q08ER8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF543Q08ER8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF543Q08ER8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF543Q08ER8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF543Q08ER8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF543Q08ER8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF543Q08ER8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF543Q08ER8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF543Q08ER8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF543Q08ER8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF543Q08ER8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF543Q08ER8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF543Q08ER8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF543Q08ER8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF543Q08ER8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF543Q08ER8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF543Q08ER8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF543Q08ER8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF543Q08ER8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF543Q08ER8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF543Q08ER8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF543Q08ER8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF543Q08ER8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF543Q08ER8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF543Q08ER8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF543Q08ER8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF543Q08ER8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF543Q08ER8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF543Q08ER8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF543Q08ER8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF543Q08ER8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF543Q08ER8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF543Q08ER8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF543Q08ER8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF543Q08ER8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF543Q08ER8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF543Q08ER8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF543Q08ER8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF543Q08ER8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF543Q08ER8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF543Q08ER8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF543Q08ER8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF543Q08ER8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF543Q08ER8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF543Q08ER8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF543Q08ER8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF543Q08ER8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF543Q08ER8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF543Q08ER8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF543Q08ER8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF543Q08ER8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF543Q08ER8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF543Q08ER8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF543Q08ER8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF543Q08ER8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF543Q08ER8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF543Q08ER8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF543Q08ER8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF543Q08ER8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF543Q08ER8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF543Q08ER8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF543Q08ER8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF543Q08ER8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF543Q08ER8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF543Q08ER8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF543Q08ER8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF543Q08ER8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF543Q08ER8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZNF543Q08ER8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF543Q08ER8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF543Q08ER8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF543Q08ER8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF543Q08ER8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF543Q08ER8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF543Q08ER8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF543Q08ER8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF543Q08ER8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF543Q08ER8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF543Q08ER8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms