Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRKCZQ05513 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRKCZQ05513 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRKCZQ05513 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRKCZQ05513 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRKCZQ05513 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKCZQ05513 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKCZQ05513 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKCZQ05513 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKCZQ05513 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKCZQ05513 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKCZQ05513 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKCZQ05513 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKCZQ05513 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PRKCZQ05513 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRKCZQ05513 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRKCZQ05513 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRKCZQ05513 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRKCZQ05513 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRKCZQ05513 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRKCZQ05513 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRKCZQ05513 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRKCZQ05513 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRKCZQ05513 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRKCZQ05513 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRKCZQ05513 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRKCZQ05513 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRKCZQ05513 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRKCZQ05513 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRKCZQ05513 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRKCZQ05513 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRKCZQ05513 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PRKCZQ05513 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRKCZQ05513 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRKCZQ05513 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRKCZQ05513 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRKCZQ05513 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRKCZQ05513 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKCZQ05513 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKCZQ05513 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKCZQ05513 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKCZQ05513 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKCZQ05513 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKCZQ05513 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKCZQ05513 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKCZQ05513 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKCZQ05513 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKCZQ05513 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKCZQ05513 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKCZQ05513 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKCZQ05513 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKCZQ05513 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKCZQ05513 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKCZQ05513 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKCZQ05513 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRKCZQ05513 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRKCZQ05513 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PRKCZQ05513 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRKCZQ05513 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRKCZQ05513 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRKCZQ05513 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRKCZQ05513 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKCZQ05513 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms