Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TAP1Q03518 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TAP1Q03518 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TAP1Q03518 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAP1Q03518 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAP1Q03518 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAP1Q03518 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAP1Q03518 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAP1Q03518 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAP1Q03518 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAP1Q03518 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAP1Q03518 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TAP1Q03518 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TAP1Q03518 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TAP1Q03518 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TAP1Q03518 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TAP1Q03518 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TAP1Q03518 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAP1Q03518 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAP1Q03518 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAP1Q03518 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAP1Q03518 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TAP1Q03518 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAP1Q03518 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAP1Q03518 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAP1Q03518 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAP1Q03518 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAP1Q03518 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAP1Q03518 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TAP1Q03518 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAP1Q03518 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAP1Q03518 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAP1Q03518 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAP1Q03518 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAP1Q03518 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAP1Q03518 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAP1Q03518 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAP1Q03518 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAP1Q03518 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAP1Q03518 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TAP1Q03518 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TAP1Q03518 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TAP1Q03518 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TAP1Q03518 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAP1Q03518 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAP1Q03518 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TAP1Q03518 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAP1Q03518 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAP1Q03518 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TAP1Q03518 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TAP1Q03518 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TAP1Q03518 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TAP1Q03518 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TAP1Q03518 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TAP1Q03518 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TAP1Q03518 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TAP1Q03518 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TAP1Q03518 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms