Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
TOP2BQ02880 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
TOP2BQ02880 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
TOP2BQ02880 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
TOP2BQ02880 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
TOP2BQ02880 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC41.51■■■■■ 4.23
TOP2BQ02880 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.51■■■■■ 4.23
TOP2BQ02880 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
TOP2BQ02880 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
TOP2BQ02880 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
TOP2BQ02880 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
TOP2BQ02880 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
TOP2BQ02880 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
TOP2BQ02880 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
TOP2BQ02880 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
TOP2BQ02880 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
TOP2BQ02880 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
TOP2BQ02880 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
TOP2BQ02880 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
TOP2BQ02880 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
TOP2BQ02880 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
TOP2BQ02880 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
TOP2BQ02880 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
TOP2BQ02880 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.23
TOP2BQ02880 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC41.44■■■■■ 4.22
TOP2BQ02880 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
TOP2BQ02880 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
TOP2BQ02880 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
TOP2BQ02880 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
TOP2BQ02880 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
TOP2BQ02880 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
TOP2BQ02880 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
TOP2BQ02880 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
TOP2BQ02880 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
TOP2BQ02880 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
TOP2BQ02880 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
TOP2BQ02880 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
TOP2BQ02880 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.41■■■■■ 4.22
TOP2BQ02880 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
TOP2BQ02880 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
TOP2BQ02880 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
TOP2BQ02880 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
TOP2BQ02880 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
TOP2BQ02880 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
TOP2BQ02880 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.22
TOP2BQ02880 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
TOP2BQ02880 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC41.38■■■■■ 4.21
TOP2BQ02880 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
TOP2BQ02880 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
TOP2BQ02880 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
TOP2BQ02880 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
TOP2BQ02880 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
TOP2BQ02880 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
TOP2BQ02880 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
TOP2BQ02880 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
TOP2BQ02880 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
TOP2BQ02880 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
TOP2BQ02880 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
TOP2BQ02880 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
TOP2BQ02880 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
TOP2BQ02880 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
TOP2BQ02880 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.2
TOP2BQ02880 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.2
TOP2BQ02880 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
TOP2BQ02880 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
TOP2BQ02880 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
TOP2BQ02880 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
TOP2BQ02880 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
TOP2BQ02880 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
TOP2BQ02880 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
TOP2BQ02880 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC41.3■■■■■ 4.2
TOP2BQ02880 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC41.3■■■■■ 4.2
TOP2BQ02880 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
TOP2BQ02880 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
TOP2BQ02880 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
TOP2BQ02880 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
TOP2BQ02880 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
TOP2BQ02880 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
TOP2BQ02880 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC41.28■■■■■ 4.2
TOP2BQ02880 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
TOP2BQ02880 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
TOP2BQ02880 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
TOP2BQ02880 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
TOP2BQ02880 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
TOP2BQ02880 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
TOP2BQ02880 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
TOP2BQ02880 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC41.26■■■■■ 4.2
TOP2BQ02880 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
TOP2BQ02880 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
TOP2BQ02880 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
TOP2BQ02880 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.19
TOP2BQ02880 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.19
TOP2BQ02880 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC41.26■■■■■ 4.19
TOP2BQ02880 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
TOP2BQ02880 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
TOP2BQ02880 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
TOP2BQ02880 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
TOP2BQ02880 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
TOP2BQ02880 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
TOP2BQ02880 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC41.22■■■■■ 4.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms