Protein–RNA interactions for Protein: Q02156

PRKCE, Protein kinase C epsilon type, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCEQ02156 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKCEQ02156 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKCEQ02156 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKCEQ02156 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKCEQ02156 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKCEQ02156 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKCEQ02156 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKCEQ02156 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKCEQ02156 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKCEQ02156 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKCEQ02156 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKCEQ02156 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKCEQ02156 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKCEQ02156 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKCEQ02156 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKCEQ02156 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRKCEQ02156 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRKCEQ02156 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRKCEQ02156 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRKCEQ02156 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRKCEQ02156 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKCEQ02156 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKCEQ02156 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKCEQ02156 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKCEQ02156 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKCEQ02156 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKCEQ02156 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKCEQ02156 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKCEQ02156 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKCEQ02156 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKCEQ02156 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKCEQ02156 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKCEQ02156 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKCEQ02156 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKCEQ02156 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKCEQ02156 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKCEQ02156 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKCEQ02156 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRKCEQ02156 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKCEQ02156 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKCEQ02156 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKCEQ02156 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKCEQ02156 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKCEQ02156 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKCEQ02156 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKCEQ02156 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKCEQ02156 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKCEQ02156 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKCEQ02156 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKCEQ02156 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKCEQ02156 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKCEQ02156 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKCEQ02156 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKCEQ02156 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKCEQ02156 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKCEQ02156 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms