Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
XPCQ01831 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
XPCQ01831 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
XPCQ01831 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
XPCQ01831 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
XPCQ01831 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
XPCQ01831 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
XPCQ01831 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
XPCQ01831 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
XPCQ01831 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
XPCQ01831 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
XPCQ01831 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
XPCQ01831 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
XPCQ01831 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
XPCQ01831 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
XPCQ01831 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
XPCQ01831 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
XPCQ01831 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
XPCQ01831 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
XPCQ01831 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
XPCQ01831 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
XPCQ01831 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
XPCQ01831 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
XPCQ01831 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
XPCQ01831 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
XPCQ01831 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
XPCQ01831 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
XPCQ01831 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
XPCQ01831 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
XPCQ01831 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
XPCQ01831 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
XPCQ01831 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC33.71■■■□□ 2.99
XPCQ01831 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
XPCQ01831 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
XPCQ01831 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
XPCQ01831 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
XPCQ01831 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
XPCQ01831 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
XPCQ01831 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
XPCQ01831 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
XPCQ01831 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
XPCQ01831 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
XPCQ01831 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
XPCQ01831 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
XPCQ01831 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
XPCQ01831 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
XPCQ01831 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
XPCQ01831 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
XPCQ01831 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
XPCQ01831 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
XPCQ01831 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
XPCQ01831 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
XPCQ01831 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
XPCQ01831 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
XPCQ01831 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
XPCQ01831 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
XPCQ01831 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
XPCQ01831 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
XPCQ01831 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
XPCQ01831 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
XPCQ01831 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
XPCQ01831 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
XPCQ01831 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
XPCQ01831 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
XPCQ01831 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
XPCQ01831 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
XPCQ01831 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
XPCQ01831 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
XPCQ01831 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
XPCQ01831 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
XPCQ01831 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
XPCQ01831 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
XPCQ01831 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
XPCQ01831 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
XPCQ01831 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
XPCQ01831 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
XPCQ01831 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
XPCQ01831 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
XPCQ01831 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
XPCQ01831 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
XPCQ01831 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
XPCQ01831 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
XPCQ01831 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
XPCQ01831 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
XPCQ01831 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
XPCQ01831 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
XPCQ01831 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
XPCQ01831 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
XPCQ01831 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
XPCQ01831 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
XPCQ01831 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
XPCQ01831 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
XPCQ01831 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
XPCQ01831 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
XPCQ01831 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
XPCQ01831 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
XPCQ01831 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
XPCQ01831 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
XPCQ01831 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
XPCQ01831 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.8 ms