Protein–RNA interactions for Protein: Q01415

GALK2, N-acetylgalactosamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALK2Q01415 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GALK2Q01415 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GALK2Q01415 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GALK2Q01415 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GALK2Q01415 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GALK2Q01415 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GALK2Q01415 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GALK2Q01415 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GALK2Q01415 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GALK2Q01415 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GALK2Q01415 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GALK2Q01415 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GALK2Q01415 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GALK2Q01415 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GALK2Q01415 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GALK2Q01415 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GALK2Q01415 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GALK2Q01415 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GALK2Q01415 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GALK2Q01415 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GALK2Q01415 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GALK2Q01415 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GALK2Q01415 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GALK2Q01415 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GALK2Q01415 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GALK2Q01415 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GALK2Q01415 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GALK2Q01415 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GALK2Q01415 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GALK2Q01415 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GALK2Q01415 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GALK2Q01415 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GALK2Q01415 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GALK2Q01415 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GALK2Q01415 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GALK2Q01415 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GALK2Q01415 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GALK2Q01415 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GALK2Q01415 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GALK2Q01415 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GALK2Q01415 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GALK2Q01415 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GALK2Q01415 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GALK2Q01415 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GALK2Q01415 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GALK2Q01415 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GALK2Q01415 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GALK2Q01415 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GALK2Q01415 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GALK2Q01415 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GALK2Q01415 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GALK2Q01415 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GALK2Q01415 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms