Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYBPC1Q00872 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYBPC1Q00872 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYBPC1Q00872 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYBPC1Q00872 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYBPC1Q00872 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MYBPC1Q00872 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYBPC1Q00872 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYBPC1Q00872 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYBPC1Q00872 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYBPC1Q00872 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYBPC1Q00872 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYBPC1Q00872 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYBPC1Q00872 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MYBPC1Q00872 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MYBPC1Q00872 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MYBPC1Q00872 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYBPC1Q00872 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYBPC1Q00872 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYBPC1Q00872 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYBPC1Q00872 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYBPC1Q00872 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYBPC1Q00872 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYBPC1Q00872 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYBPC1Q00872 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYBPC1Q00872 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MYBPC1Q00872 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYBPC1Q00872 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYBPC1Q00872 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYBPC1Q00872 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MYBPC1Q00872 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYBPC1Q00872 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYBPC1Q00872 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYBPC1Q00872 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYBPC1Q00872 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYBPC1Q00872 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYBPC1Q00872 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MYBPC1Q00872 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYBPC1Q00872 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYBPC1Q00872 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYBPC1Q00872 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYBPC1Q00872 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYBPC1Q00872 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYBPC1Q00872 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYBPC1Q00872 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYBPC1Q00872 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYBPC1Q00872 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYBPC1Q00872 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYBPC1Q00872 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYBPC1Q00872 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYBPC1Q00872 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MYBPC1Q00872 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYBPC1Q00872 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MYBPC1Q00872 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYBPC1Q00872 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYBPC1Q00872 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYBPC1Q00872 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYBPC1Q00872 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms