Protein–RNA interactions for Protein: P63244

RACK1, Receptor of activated protein C kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RACK1P63244 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RACK1P63244 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RACK1P63244 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RACK1P63244 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RACK1P63244 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RACK1P63244 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RACK1P63244 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RACK1P63244 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RACK1P63244 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RACK1P63244 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RACK1P63244 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RACK1P63244 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RACK1P63244 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RACK1P63244 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RACK1P63244 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RACK1P63244 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RACK1P63244 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RACK1P63244 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RACK1P63244 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RACK1P63244 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RACK1P63244 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RACK1P63244 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RACK1P63244 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RACK1P63244 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RACK1P63244 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RACK1P63244 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RACK1P63244 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RACK1P63244 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RACK1P63244 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RACK1P63244 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RACK1P63244 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RACK1P63244 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RACK1P63244 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RACK1P63244 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RACK1P63244 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RACK1P63244 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RACK1P63244 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RACK1P63244 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RACK1P63244 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RACK1P63244 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RACK1P63244 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RACK1P63244 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RACK1P63244 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RACK1P63244 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RACK1P63244 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RACK1P63244 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RACK1P63244 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RACK1P63244 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RACK1P63244 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RACK1P63244 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RACK1P63244 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RACK1P63244 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RACK1P63244 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RACK1P63244 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RACK1P63244 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RACK1P63244 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RACK1P63244 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RACK1P63244 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RACK1P63244 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RACK1P63244 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RACK1P63244 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RACK1P63244 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RACK1P63244 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RACK1P63244 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RACK1P63244 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RACK1P63244 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RACK1P63244 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RACK1P63244 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RACK1P63244 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RACK1P63244 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RACK1P63244 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RACK1P63244 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RACK1P63244 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RACK1P63244 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RACK1P63244 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RACK1P63244 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RACK1P63244 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RACK1P63244 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RACK1P63244 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RACK1P63244 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RACK1P63244 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RACK1P63244 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RACK1P63244 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RACK1P63244 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RACK1P63244 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RACK1P63244 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RACK1P63244 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RACK1P63244 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RACK1P63244 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RACK1P63244 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RACK1P63244 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RACK1P63244 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RACK1P63244 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RACK1P63244 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RACK1P63244 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RACK1P63244 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RACK1P63244 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RACK1P63244 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RACK1P63244 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RACK1P63244 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms