Protein–RNA interactions for Protein: P62899

RPL31, 60S ribosomal protein L31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL31P62899 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL31P62899 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL31P62899 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL31P62899 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL31P62899 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL31P62899 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL31P62899 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL31P62899 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL31P62899 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL31P62899 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL31P62899 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL31P62899 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL31P62899 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL31P62899 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL31P62899 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL31P62899 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL31P62899 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL31P62899 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL31P62899 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL31P62899 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL31P62899 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL31P62899 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL31P62899 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL31P62899 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL31P62899 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL31P62899 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL31P62899 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL31P62899 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL31P62899 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL31P62899 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL31P62899 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL31P62899 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL31P62899 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL31P62899 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL31P62899 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL31P62899 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL31P62899 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL31P62899 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL31P62899 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL31P62899 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL31P62899 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL31P62899 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL31P62899 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL31P62899 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL31P62899 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL31P62899 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL31P62899 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL31P62899 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL31P62899 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL31P62899 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL31P62899 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL31P62899 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL31P62899 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL31P62899 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL31P62899 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL31P62899 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL31P62899 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL31P62899 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL31P62899 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL31P62899 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL31P62899 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL31P62899 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL31P62899 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL31P62899 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL31P62899 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL31P62899 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL31P62899 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL31P62899 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL31P62899 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL31P62899 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL31P62899 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL31P62899 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL31P62899 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL31P62899 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL31P62899 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL31P62899 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL31P62899 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL31P62899 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL31P62899 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL31P62899 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL31P62899 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL31P62899 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL31P62899 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL31P62899 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RPL31P62899 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL31P62899 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL31P62899 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL31P62899 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL31P62899 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL31P62899 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL31P62899 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL31P62899 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL31P62899 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL31P62899 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL31P62899 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL31P62899 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL31P62899 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL31P62899 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL31P62899 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL31P62899 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms