Protein–RNA interactions for Protein: P56747

CLDN6, Claudin-6, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN6P56747 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN6P56747 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN6P56747 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN6P56747 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN6P56747 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN6P56747 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN6P56747 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN6P56747 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN6P56747 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN6P56747 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN6P56747 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN6P56747 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN6P56747 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN6P56747 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN6P56747 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN6P56747 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN6P56747 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN6P56747 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN6P56747 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN6P56747 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN6P56747 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN6P56747 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN6P56747 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN6P56747 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN6P56747 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN6P56747 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN6P56747 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN6P56747 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN6P56747 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN6P56747 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN6P56747 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN6P56747 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN6P56747 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN6P56747 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN6P56747 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN6P56747 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN6P56747 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN6P56747 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN6P56747 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN6P56747 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN6P56747 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN6P56747 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN6P56747 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN6P56747 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN6P56747 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN6P56747 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN6P56747 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN6P56747 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN6P56747 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN6P56747 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN6P56747 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN6P56747 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN6P56747 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN6P56747 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN6P56747 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN6P56747 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN6P56747 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN6P56747 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN6P56747 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms