Protein–RNA interactions for Protein: P55017

SLC12A3, Solute carrier family 12 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A3P55017 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC12A3P55017 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC12A3P55017 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC12A3P55017 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC12A3P55017 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC12A3P55017 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC12A3P55017 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC12A3P55017 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC12A3P55017 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC12A3P55017 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC12A3P55017 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC12A3P55017 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC12A3P55017 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC12A3P55017 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC12A3P55017 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC12A3P55017 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC12A3P55017 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC12A3P55017 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC12A3P55017 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC12A3P55017 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC12A3P55017 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC12A3P55017 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC12A3P55017 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC12A3P55017 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC12A3P55017 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC12A3P55017 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC12A3P55017 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC12A3P55017 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC12A3P55017 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC12A3P55017 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC12A3P55017 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC12A3P55017 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC12A3P55017 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC12A3P55017 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC12A3P55017 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC12A3P55017 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC12A3P55017 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC12A3P55017 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC12A3P55017 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC12A3P55017 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC12A3P55017 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC12A3P55017 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC12A3P55017 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC12A3P55017 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC12A3P55017 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC12A3P55017 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC12A3P55017 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC12A3P55017 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC12A3P55017 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC12A3P55017 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC12A3P55017 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC12A3P55017 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC12A3P55017 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC12A3P55017 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC12A3P55017 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC12A3P55017 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC12A3P55017 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC12A3P55017 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC12A3P55017 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC12A3P55017 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC12A3P55017 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC12A3P55017 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC12A3P55017 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC12A3P55017 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC12A3P55017 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC12A3P55017 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC12A3P55017 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC12A3P55017 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC12A3P55017 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC12A3P55017 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC12A3P55017 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC12A3P55017 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC12A3P55017 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC12A3P55017 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC12A3P55017 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC12A3P55017 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC12A3P55017 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC12A3P55017 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC12A3P55017 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC12A3P55017 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC12A3P55017 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC12A3P55017 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC12A3P55017 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC12A3P55017 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC12A3P55017 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC12A3P55017 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC12A3P55017 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC12A3P55017 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC12A3P55017 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC12A3P55017 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC12A3P55017 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC12A3P55017 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC12A3P55017 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC12A3P55017 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC12A3P55017 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC12A3P55017 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC12A3P55017 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SLC12A3P55017 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC12A3P55017 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SLC12A3P55017 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms