Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP1B3P54709 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP1B3P54709 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP1B3P54709 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP1B3P54709 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP1B3P54709 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP1B3P54709 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP1B3P54709 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP1B3P54709 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP1B3P54709 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP1B3P54709 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP1B3P54709 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP1B3P54709 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP1B3P54709 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP1B3P54709 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP1B3P54709 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP1B3P54709 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP1B3P54709 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP1B3P54709 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP1B3P54709 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP1B3P54709 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP1B3P54709 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP1B3P54709 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP1B3P54709 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP1B3P54709 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP1B3P54709 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP1B3P54709 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP1B3P54709 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP1B3P54709 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
ATP1B3P54709 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATP1B3P54709 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATP1B3P54709 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms