Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HIRAP54198 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HIRAP54198 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HIRAP54198 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HIRAP54198 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HIRAP54198 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HIRAP54198 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HIRAP54198 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HIRAP54198 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HIRAP54198 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
HIRAP54198 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
HIRAP54198 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
HIRAP54198 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
HIRAP54198 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HIRAP54198 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HIRAP54198 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HIRAP54198 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HIRAP54198 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
HIRAP54198 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
HIRAP54198 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HIRAP54198 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HIRAP54198 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HIRAP54198 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HIRAP54198 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HIRAP54198 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HIRAP54198 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HIRAP54198 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
HIRAP54198 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HIRAP54198 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HIRAP54198 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HIRAP54198 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HIRAP54198 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HIRAP54198 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HIRAP54198 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HIRAP54198 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HIRAP54198 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HIRAP54198 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HIRAP54198 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HIRAP54198 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HIRAP54198 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HIRAP54198 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HIRAP54198 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HIRAP54198 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HIRAP54198 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HIRAP54198 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
HIRAP54198 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
HIRAP54198 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HIRAP54198 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HIRAP54198 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HIRAP54198 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HIRAP54198 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HIRAP54198 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HIRAP54198 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HIRAP54198 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HIRAP54198 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HIRAP54198 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HIRAP54198 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HIRAP54198 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
HIRAP54198 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HIRAP54198 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HIRAP54198 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HIRAP54198 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HIRAP54198 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HIRAP54198 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HIRAP54198 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HIRAP54198 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HIRAP54198 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HIRAP54198 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HIRAP54198 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HIRAP54198 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HIRAP54198 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HIRAP54198 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HIRAP54198 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HIRAP54198 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HIRAP54198 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HIRAP54198 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HIRAP54198 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HIRAP54198 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HIRAP54198 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HIRAP54198 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HIRAP54198 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HIRAP54198 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
HIRAP54198 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
HIRAP54198 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HIRAP54198 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HIRAP54198 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HIRAP54198 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HIRAP54198 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HIRAP54198 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
HIRAP54198 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HIRAP54198 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HIRAP54198 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HIRAP54198 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HIRAP54198 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HIRAP54198 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HIRAP54198 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HIRAP54198 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HIRAP54198 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HIRAP54198 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HIRAP54198 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms