Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LBX1P52954 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LBX1P52954 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LBX1P52954 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LBX1P52954 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LBX1P52954 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
LBX1P52954 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LBX1P52954 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LBX1P52954 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LBX1P52954 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LBX1P52954 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LBX1P52954 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
LBX1P52954 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LBX1P52954 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LBX1P52954 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LBX1P52954 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
LBX1P52954 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LBX1P52954 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LBX1P52954 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LBX1P52954 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LBX1P52954 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LBX1P52954 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LBX1P52954 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
LBX1P52954 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LBX1P52954 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LBX1P52954 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LBX1P52954 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
LBX1P52954 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LBX1P52954 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LBX1P52954 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LBX1P52954 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LBX1P52954 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LBX1P52954 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
LBX1P52954 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LBX1P52954 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LBX1P52954 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LBX1P52954 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LBX1P52954 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LBX1P52954 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LBX1P52954 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LBX1P52954 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
LBX1P52954 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LBX1P52954 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LBX1P52954 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LBX1P52954 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LBX1P52954 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LBX1P52954 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LBX1P52954 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LBX1P52954 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
LBX1P52954 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LBX1P52954 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LBX1P52954 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
LBX1P52954 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LBX1P52954 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LBX1P52954 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LBX1P52954 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LBX1P52954 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LBX1P52954 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LBX1P52954 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LBX1P52954 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LBX1P52954 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LBX1P52954 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LBX1P52954 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LBX1P52954 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LBX1P52954 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LBX1P52954 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LBX1P52954 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LBX1P52954 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LBX1P52954 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LBX1P52954 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LBX1P52954 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LBX1P52954 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LBX1P52954 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LBX1P52954 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LBX1P52954 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LBX1P52954 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LBX1P52954 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LBX1P52954 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LBX1P52954 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LBX1P52954 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
LBX1P52954 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LBX1P52954 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LBX1P52954 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LBX1P52954 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LBX1P52954 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LBX1P52954 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LBX1P52954 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LBX1P52954 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LBX1P52954 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LBX1P52954 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
LBX1P52954 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LBX1P52954 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LBX1P52954 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LBX1P52954 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LBX1P52954 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LBX1P52954 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LBX1P52954 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LBX1P52954 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LBX1P52954 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LBX1P52954 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms