Protein–RNA interactions for Protein: P51809

VAMP7, Vesicle-associated membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP7P51809 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
VAMP7P51809 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VAMP7P51809 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VAMP7P51809 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VAMP7P51809 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VAMP7P51809 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VAMP7P51809 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VAMP7P51809 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VAMP7P51809 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VAMP7P51809 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VAMP7P51809 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VAMP7P51809 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VAMP7P51809 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
VAMP7P51809 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
VAMP7P51809 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VAMP7P51809 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VAMP7P51809 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
VAMP7P51809 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VAMP7P51809 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VAMP7P51809 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VAMP7P51809 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VAMP7P51809 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VAMP7P51809 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VAMP7P51809 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VAMP7P51809 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VAMP7P51809 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
VAMP7P51809 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
VAMP7P51809 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VAMP7P51809 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VAMP7P51809 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VAMP7P51809 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VAMP7P51809 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VAMP7P51809 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VAMP7P51809 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VAMP7P51809 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VAMP7P51809 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VAMP7P51809 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VAMP7P51809 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VAMP7P51809 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
VAMP7P51809 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VAMP7P51809 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VAMP7P51809 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VAMP7P51809 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VAMP7P51809 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAMP7P51809 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
VAMP7P51809 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAMP7P51809 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAMP7P51809 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAMP7P51809 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAMP7P51809 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAMP7P51809 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAMP7P51809 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAMP7P51809 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAMP7P51809 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAMP7P51809 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAMP7P51809 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAMP7P51809 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAMP7P51809 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAMP7P51809 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAMP7P51809 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAMP7P51809 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAMP7P51809 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAMP7P51809 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAMP7P51809 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAMP7P51809 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAMP7P51809 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VAMP7P51809 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VAMP7P51809 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
VAMP7P51809 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VAMP7P51809 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VAMP7P51809 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VAMP7P51809 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VAMP7P51809 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VAMP7P51809 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VAMP7P51809 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
VAMP7P51809 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VAMP7P51809 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VAMP7P51809 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VAMP7P51809 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
VAMP7P51809 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
VAMP7P51809 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VAMP7P51809 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VAMP7P51809 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VAMP7P51809 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VAMP7P51809 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VAMP7P51809 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VAMP7P51809 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VAMP7P51809 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VAMP7P51809 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VAMP7P51809 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VAMP7P51809 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
VAMP7P51809 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VAMP7P51809 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VAMP7P51809 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VAMP7P51809 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VAMP7P51809 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VAMP7P51809 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VAMP7P51809 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
VAMP7P51809 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VAMP7P51809 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms