Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE6CP51160 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE6CP51160 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE6CP51160 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE6CP51160 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE6CP51160 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE6CP51160 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE6CP51160 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE6CP51160 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE6CP51160 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE6CP51160 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE6CP51160 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE6CP51160 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE6CP51160 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE6CP51160 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE6CP51160 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE6CP51160 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE6CP51160 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE6CP51160 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE6CP51160 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE6CP51160 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE6CP51160 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDE6CP51160 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDE6CP51160 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE6CP51160 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE6CP51160 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE6CP51160 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE6CP51160 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE6CP51160 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE6CP51160 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE6CP51160 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE6CP51160 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE6CP51160 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE6CP51160 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE6CP51160 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE6CP51160 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE6CP51160 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE6CP51160 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE6CP51160 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE6CP51160 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE6CP51160 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE6CP51160 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE6CP51160 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE6CP51160 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE6CP51160 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE6CP51160 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE6CP51160 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE6CP51160 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE6CP51160 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE6CP51160 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE6CP51160 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE6CP51160 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE6CP51160 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE6CP51160 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE6CP51160 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE6CP51160 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE6CP51160 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE6CP51160 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE6CP51160 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE6CP51160 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE6CP51160 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE6CP51160 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE6CP51160 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE6CP51160 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE6CP51160 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE6CP51160 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE6CP51160 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE6CP51160 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE6CP51160 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE6CP51160 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE6CP51160 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE6CP51160 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE6CP51160 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE6CP51160 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE6CP51160 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE6CP51160 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE6CP51160 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE6CP51160 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE6CP51160 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE6CP51160 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE6CP51160 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE6CP51160 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE6CP51160 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE6CP51160 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE6CP51160 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE6CP51160 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE6CP51160 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE6CP51160 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE6CP51160 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE6CP51160 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE6CP51160 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE6CP51160 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE6CP51160 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE6CP51160 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE6CP51160 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE6CP51160 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE6CP51160 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE6CP51160 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE6CP51160 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE6CP51160 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms