Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSEN1P49768 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSEN1P49768 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSEN1P49768 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSEN1P49768 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSEN1P49768 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSEN1P49768 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSEN1P49768 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSEN1P49768 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSEN1P49768 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSEN1P49768 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSEN1P49768 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSEN1P49768 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSEN1P49768 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSEN1P49768 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSEN1P49768 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSEN1P49768 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSEN1P49768 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PSEN1P49768 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PSEN1P49768 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSEN1P49768 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSEN1P49768 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSEN1P49768 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSEN1P49768 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSEN1P49768 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSEN1P49768 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSEN1P49768 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PSEN1P49768 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSEN1P49768 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSEN1P49768 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSEN1P49768 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PSEN1P49768 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSEN1P49768 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSEN1P49768 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSEN1P49768 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSEN1P49768 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSEN1P49768 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSEN1P49768 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSEN1P49768 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSEN1P49768 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSEN1P49768 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSEN1P49768 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSEN1P49768 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSEN1P49768 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSEN1P49768 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSEN1P49768 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSEN1P49768 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSEN1P49768 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSEN1P49768 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSEN1P49768 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSEN1P49768 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSEN1P49768 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSEN1P49768 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSEN1P49768 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSEN1P49768 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSEN1P49768 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSEN1P49768 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms