Protein–RNA interactions for Protein: P49682

CXCR3, C-X-C chemokine receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR3P49682 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXCR3P49682 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CXCR3P49682 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXCR3P49682 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXCR3P49682 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXCR3P49682 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCR3P49682 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCR3P49682 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCR3P49682 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCR3P49682 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCR3P49682 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCR3P49682 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCR3P49682 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCR3P49682 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCR3P49682 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCR3P49682 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCR3P49682 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCR3P49682 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCR3P49682 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCR3P49682 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CXCR3P49682 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CXCR3P49682 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCR3P49682 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCR3P49682 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCR3P49682 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCR3P49682 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCR3P49682 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCR3P49682 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCR3P49682 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CXCR3P49682 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCR3P49682 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCR3P49682 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCR3P49682 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCR3P49682 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCR3P49682 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCR3P49682 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCR3P49682 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCR3P49682 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCR3P49682 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCR3P49682 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCR3P49682 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCR3P49682 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCR3P49682 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCR3P49682 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CXCR3P49682 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCR3P49682 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCR3P49682 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCR3P49682 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCR3P49682 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCR3P49682 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CXCR3P49682 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCR3P49682 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCR3P49682 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCR3P49682 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCR3P49682 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCR3P49682 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCR3P49682 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCR3P49682 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCR3P49682 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCR3P49682 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCR3P49682 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCR3P49682 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXCR3P49682 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXCR3P49682 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXCR3P49682 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXCR3P49682 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXCR3P49682 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCR3P49682 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCR3P49682 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCR3P49682 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCR3P49682 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCR3P49682 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCR3P49682 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCR3P49682 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCR3P49682 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CXCR3P49682 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CXCR3P49682 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CXCR3P49682 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CXCR3P49682 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CXCR3P49682 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CXCR3P49682 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CXCR3P49682 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CXCR3P49682 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCR3P49682 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCR3P49682 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCR3P49682 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCR3P49682 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCR3P49682 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCR3P49682 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCR3P49682 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCR3P49682 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCR3P49682 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCR3P49682 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCR3P49682 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCR3P49682 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCR3P49682 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCR3P49682 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCR3P49682 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCR3P49682 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCR3P49682 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms