Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTPAP49638 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTPAP49638 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTPAP49638 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTPAP49638 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TTPAP49638 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTPAP49638 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTPAP49638 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTPAP49638 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTPAP49638 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTPAP49638 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTPAP49638 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTPAP49638 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTPAP49638 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTPAP49638 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TTPAP49638 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TTPAP49638 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTPAP49638 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTPAP49638 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTPAP49638 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TTPAP49638 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTPAP49638 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTPAP49638 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTPAP49638 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TTPAP49638 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTPAP49638 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTPAP49638 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTPAP49638 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTPAP49638 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTPAP49638 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTPAP49638 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTPAP49638 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTPAP49638 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTPAP49638 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTPAP49638 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTPAP49638 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTPAP49638 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTPAP49638 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTPAP49638 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTPAP49638 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTPAP49638 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTPAP49638 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTPAP49638 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTPAP49638 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTPAP49638 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTPAP49638 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTPAP49638 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTPAP49638 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTPAP49638 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TTPAP49638 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTPAP49638 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTPAP49638 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TTPAP49638 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTPAP49638 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTPAP49638 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTPAP49638 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTPAP49638 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTPAP49638 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTPAP49638 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TTPAP49638 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTPAP49638 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTPAP49638 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTPAP49638 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTPAP49638 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTPAP49638 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTPAP49638 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTPAP49638 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTPAP49638 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTPAP49638 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTPAP49638 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTPAP49638 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTPAP49638 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTPAP49638 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTPAP49638 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTPAP49638 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTPAP49638 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTPAP49638 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TTPAP49638 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TTPAP49638 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTPAP49638 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTPAP49638 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTPAP49638 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTPAP49638 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTPAP49638 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTPAP49638 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTPAP49638 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTPAP49638 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTPAP49638 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TTPAP49638 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTPAP49638 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTPAP49638 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTPAP49638 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTPAP49638 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTPAP49638 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTPAP49638 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTPAP49638 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTPAP49638 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TTPAP49638 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTPAP49638 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTPAP49638 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
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