Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC11A1P49279 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC11A1P49279 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC11A1P49279 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC11A1P49279 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC11A1P49279 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC11A1P49279 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC11A1P49279 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC11A1P49279 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC11A1P49279 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC11A1P49279 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC11A1P49279 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC11A1P49279 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC11A1P49279 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC11A1P49279 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC11A1P49279 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC11A1P49279 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC11A1P49279 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC11A1P49279 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC11A1P49279 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC11A1P49279 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC11A1P49279 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC11A1P49279 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC11A1P49279 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC11A1P49279 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC11A1P49279 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC11A1P49279 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC11A1P49279 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC11A1P49279 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC11A1P49279 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC11A1P49279 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC11A1P49279 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC11A1P49279 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC11A1P49279 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC11A1P49279 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC11A1P49279 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC11A1P49279 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC11A1P49279 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC11A1P49279 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC11A1P49279 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC11A1P49279 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC11A1P49279 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC11A1P49279 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC11A1P49279 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC11A1P49279 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC11A1P49279 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC11A1P49279 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC11A1P49279 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC11A1P49279 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC11A1P49279 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC11A1P49279 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC11A1P49279 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC11A1P49279 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC11A1P49279 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC11A1P49279 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC11A1P49279 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC11A1P49279 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC11A1P49279 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC11A1P49279 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC11A1P49279 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC11A1P49279 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC11A1P49279 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC11A1P49279 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC11A1P49279 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC11A1P49279 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC11A1P49279 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC11A1P49279 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC11A1P49279 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC11A1P49279 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC11A1P49279 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC11A1P49279 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC11A1P49279 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC11A1P49279 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC11A1P49279 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC11A1P49279 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC11A1P49279 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC11A1P49279 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC11A1P49279 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC11A1P49279 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC11A1P49279 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC11A1P49279 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC11A1P49279 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC11A1P49279 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC11A1P49279 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC11A1P49279 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC11A1P49279 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC11A1P49279 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC11A1P49279 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC11A1P49279 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC11A1P49279 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC11A1P49279 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC11A1P49279 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC11A1P49279 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC11A1P49279 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC11A1P49279 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC11A1P49279 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC11A1P49279 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms