Protein–RNA interactions for Protein: P48378

RFX2, DNA-binding protein RFX2, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX2P48378 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RFX2P48378 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RFX2P48378 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RFX2P48378 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFX2P48378 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFX2P48378 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFX2P48378 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFX2P48378 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFX2P48378 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFX2P48378 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFX2P48378 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFX2P48378 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFX2P48378 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFX2P48378 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFX2P48378 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFX2P48378 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFX2P48378 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFX2P48378 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFX2P48378 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFX2P48378 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFX2P48378 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFX2P48378 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFX2P48378 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFX2P48378 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFX2P48378 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RFX2P48378 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFX2P48378 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFX2P48378 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFX2P48378 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFX2P48378 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFX2P48378 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFX2P48378 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFX2P48378 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFX2P48378 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFX2P48378 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFX2P48378 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFX2P48378 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFX2P48378 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFX2P48378 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFX2P48378 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFX2P48378 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFX2P48378 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFX2P48378 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFX2P48378 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFX2P48378 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFX2P48378 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RFX2P48378 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RFX2P48378 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RFX2P48378 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RFX2P48378 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RFX2P48378 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RFX2P48378 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RFX2P48378 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RFX2P48378 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFX2P48378 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFX2P48378 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFX2P48378 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFX2P48378 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFX2P48378 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFX2P48378 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFX2P48378 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RFX2P48378 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RFX2P48378 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RFX2P48378 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RFX2P48378 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RFX2P48378 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RFX2P48378 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RFX2P48378 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RFX2P48378 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RFX2P48378 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RFX2P48378 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RFX2P48378 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RFX2P48378 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RFX2P48378 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RFX2P48378 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RFX2P48378 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RFX2P48378 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RFX2P48378 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RFX2P48378 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RFX2P48378 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RFX2P48378 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RFX2P48378 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RFX2P48378 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RFX2P48378 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RFX2P48378 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RFX2P48378 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RFX2P48378 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RFX2P48378 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RFX2P48378 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RFX2P48378 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RFX2P48378 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFX2P48378 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFX2P48378 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFX2P48378 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFX2P48378 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFX2P48378 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFX2P48378 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RFX2P48378 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RFX2P48378 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RFX2P48378 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms