Protein–RNA interactions for Protein: P47755

CAPZA2, F-actin-capping protein subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA2P47755 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPZA2P47755 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPZA2P47755 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPZA2P47755 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPZA2P47755 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPZA2P47755 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPZA2P47755 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPZA2P47755 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPZA2P47755 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPZA2P47755 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPZA2P47755 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPZA2P47755 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPZA2P47755 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPZA2P47755 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPZA2P47755 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPZA2P47755 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPZA2P47755 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPZA2P47755 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPZA2P47755 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPZA2P47755 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPZA2P47755 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPZA2P47755 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPZA2P47755 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZA2P47755 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZA2P47755 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZA2P47755 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZA2P47755 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZA2P47755 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZA2P47755 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZA2P47755 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZA2P47755 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZA2P47755 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZA2P47755 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZA2P47755 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZA2P47755 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZA2P47755 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZA2P47755 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZA2P47755 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZA2P47755 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZA2P47755 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZA2P47755 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZA2P47755 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZA2P47755 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZA2P47755 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CAPZA2P47755 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CAPZA2P47755 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPZA2P47755 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPZA2P47755 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPZA2P47755 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms