Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP13P45452 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP13P45452 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP13P45452 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP13P45452 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP13P45452 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP13P45452 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP13P45452 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP13P45452 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP13P45452 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP13P45452 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP13P45452 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP13P45452 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP13P45452 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP13P45452 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP13P45452 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP13P45452 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP13P45452 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP13P45452 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP13P45452 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.64
MMP13P45452 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP13P45452 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP13P45452 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP13P45452 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP13P45452 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP13P45452 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP13P45452 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP13P45452 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP13P45452 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP13P45452 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP13P45452 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP13P45452 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP13P45452 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP13P45452 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP13P45452 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP13P45452 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP13P45452 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP13P45452 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP13P45452 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP13P45452 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP13P45452 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP13P45452 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP13P45452 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP13P45452 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP13P45452 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP13P45452 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP13P45452 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP13P45452 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP13P45452 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP13P45452 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP13P45452 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP13P45452 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP13P45452 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP13P45452 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP13P45452 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP13P45452 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP13P45452 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP13P45452 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP13P45452 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP13P45452 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP13P45452 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP13P45452 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP13P45452 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP13P45452 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP13P45452 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP13P45452 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP13P45452 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP13P45452 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP13P45452 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP13P45452 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP13P45452 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP13P45452 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP13P45452 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP13P45452 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP13P45452 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP13P45452 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP13P45452 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP13P45452 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP13P45452 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP13P45452 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP13P45452 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP13P45452 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP13P45452 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP13P45452 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP13P45452 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP13P45452 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MMP13P45452 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MMP13P45452 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MMP13P45452 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP13P45452 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP13P45452 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP13P45452 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP13P45452 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP13P45452 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP13P45452 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP13P45452 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP13P45452 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP13P45452 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP13P45452 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP13P45452 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms