Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RCVRNP35243 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RCVRNP35243 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RCVRNP35243 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RCVRNP35243 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RCVRNP35243 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RCVRNP35243 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RCVRNP35243 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RCVRNP35243 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RCVRNP35243 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RCVRNP35243 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RCVRNP35243 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RCVRNP35243 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RCVRNP35243 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RCVRNP35243 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RCVRNP35243 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RCVRNP35243 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RCVRNP35243 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RCVRNP35243 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RCVRNP35243 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RCVRNP35243 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RCVRNP35243 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RCVRNP35243 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RCVRNP35243 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RCVRNP35243 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RCVRNP35243 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RCVRNP35243 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RCVRNP35243 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RCVRNP35243 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RCVRNP35243 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RCVRNP35243 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RCVRNP35243 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RCVRNP35243 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RCVRNP35243 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RCVRNP35243 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RCVRNP35243 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RCVRNP35243 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RCVRNP35243 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RCVRNP35243 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RCVRNP35243 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RCVRNP35243 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RCVRNP35243 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RCVRNP35243 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RCVRNP35243 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RCVRNP35243 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RCVRNP35243 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RCVRNP35243 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RCVRNP35243 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RCVRNP35243 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RCVRNP35243 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RCVRNP35243 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RCVRNP35243 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RCVRNP35243 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RCVRNP35243 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RCVRNP35243 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RCVRNP35243 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RCVRNP35243 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RCVRNP35243 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms