Protein–RNA interactions for Protein: P35218

CA5A, Carbonic anhydrase 5A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA5AP35218 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CA5AP35218 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CA5AP35218 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CA5AP35218 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CA5AP35218 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CA5AP35218 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CA5AP35218 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CA5AP35218 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CA5AP35218 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CA5AP35218 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CA5AP35218 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CA5AP35218 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CA5AP35218 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CA5AP35218 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CA5AP35218 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CA5AP35218 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CA5AP35218 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CA5AP35218 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CA5AP35218 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CA5AP35218 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CA5AP35218 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CA5AP35218 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CA5AP35218 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CA5AP35218 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CA5AP35218 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CA5AP35218 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CA5AP35218 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CA5AP35218 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CA5AP35218 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CA5AP35218 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CA5AP35218 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CA5AP35218 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CA5AP35218 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CA5AP35218 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CA5AP35218 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CA5AP35218 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CA5AP35218 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CA5AP35218 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CA5AP35218 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CA5AP35218 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CA5AP35218 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CA5AP35218 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CA5AP35218 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CA5AP35218 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CA5AP35218 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CA5AP35218 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CA5AP35218 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CA5AP35218 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CA5AP35218 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CA5AP35218 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CA5AP35218 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CA5AP35218 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CA5AP35218 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CA5AP35218 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CA5AP35218 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CA5AP35218 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CA5AP35218 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CA5AP35218 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CA5AP35218 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CA5AP35218 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CA5AP35218 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CA5AP35218 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CA5AP35218 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CA5AP35218 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CA5AP35218 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CA5AP35218 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CA5AP35218 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CA5AP35218 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CA5AP35218 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CA5AP35218 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CA5AP35218 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CA5AP35218 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CA5AP35218 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CA5AP35218 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CA5AP35218 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CA5AP35218 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CA5AP35218 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CA5AP35218 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CA5AP35218 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CA5AP35218 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CA5AP35218 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CA5AP35218 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CA5AP35218 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CA5AP35218 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CA5AP35218 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CA5AP35218 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CA5AP35218 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CA5AP35218 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CA5AP35218 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CA5AP35218 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CA5AP35218 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CA5AP35218 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CA5AP35218 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CA5AP35218 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CA5AP35218 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CA5AP35218 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CA5AP35218 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CA5AP35218 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CA5AP35218 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CA5AP35218 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms