Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDC27P30260 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDC27P30260 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDC27P30260 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CDC27P30260 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
CDC27P30260 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CDC27P30260 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CDC27P30260 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDC27P30260 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CDC27P30260 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDC27P30260 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDC27P30260 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDC27P30260 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CDC27P30260 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDC27P30260 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDC27P30260 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDC27P30260 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDC27P30260 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDC27P30260 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDC27P30260 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDC27P30260 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDC27P30260 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDC27P30260 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDC27P30260 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDC27P30260 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDC27P30260 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDC27P30260 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDC27P30260 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDC27P30260 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDC27P30260 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDC27P30260 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDC27P30260 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDC27P30260 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDC27P30260 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDC27P30260 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDC27P30260 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDC27P30260 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDC27P30260 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDC27P30260 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CDC27P30260 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
CDC27P30260 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDC27P30260 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDC27P30260 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDC27P30260 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDC27P30260 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CDC27P30260 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDC27P30260 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDC27P30260 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDC27P30260 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDC27P30260 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDC27P30260 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDC27P30260 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDC27P30260 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDC27P30260 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDC27P30260 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDC27P30260 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDC27P30260 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDC27P30260 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDC27P30260 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDC27P30260 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDC27P30260 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDC27P30260 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDC27P30260 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDC27P30260 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDC27P30260 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDC27P30260 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDC27P30260 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CDC27P30260 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDC27P30260 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDC27P30260 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDC27P30260 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDC27P30260 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDC27P30260 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDC27P30260 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDC27P30260 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CDC27P30260 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDC27P30260 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDC27P30260 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDC27P30260 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDC27P30260 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CDC27P30260 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDC27P30260 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDC27P30260 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDC27P30260 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDC27P30260 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDC27P30260 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDC27P30260 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDC27P30260 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDC27P30260 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDC27P30260 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDC27P30260 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDC27P30260 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDC27P30260 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDC27P30260 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CDC27P30260 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CDC27P30260 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDC27P30260 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDC27P30260 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDC27P30260 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDC27P30260 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206 ms