Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATP2B4P23634 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATP2B4P23634 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATP2B4P23634 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATP2B4P23634 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATP2B4P23634 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ATP2B4P23634 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATP2B4P23634 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30■■■□□ 2.39
ATP2B4P23634 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
ATP2B4P23634 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATP2B4P23634 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATP2B4P23634 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
ATP2B4P23634 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATP2B4P23634 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATP2B4P23634 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP2B4P23634 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP2B4P23634 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP2B4P23634 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP2B4P23634 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP2B4P23634 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP2B4P23634 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATP2B4P23634 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATP2B4P23634 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP2B4P23634 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP2B4P23634 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ATP2B4P23634 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ATP2B4P23634 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ATP2B4P23634 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ATP2B4P23634 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ATP2B4P23634 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ATP2B4P23634 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ATP2B4P23634 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
ATP2B4P23634 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP2B4P23634 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP2B4P23634 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP2B4P23634 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATP2B4P23634 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
ATP2B4P23634 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATP2B4P23634 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATP2B4P23634 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATP2B4P23634 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATP2B4P23634 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATP2B4P23634 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATP2B4P23634 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATP2B4P23634 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATP2B4P23634 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ATP2B4P23634 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATP2B4P23634 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATP2B4P23634 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATP2B4P23634 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATP2B4P23634 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATP2B4P23634 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATP2B4P23634 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
ATP2B4P23634 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATP2B4P23634 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATP2B4P23634 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATP2B4P23634 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATP2B4P23634 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATP2B4P23634 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
ATP2B4P23634 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATP2B4P23634 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATP2B4P23634 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATP2B4P23634 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
ATP2B4P23634 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATP2B4P23634 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATP2B4P23634 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATP2B4P23634 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATP2B4P23634 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATP2B4P23634 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATP2B4P23634 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATP2B4P23634 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATP2B4P23634 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATP2B4P23634 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATP2B4P23634 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATP2B4P23634 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATP2B4P23634 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATP2B4P23634 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATP2B4P23634 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATP2B4P23634 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATP2B4P23634 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATP2B4P23634 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATP2B4P23634 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATP2B4P23634 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATP2B4P23634 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATP2B4P23634 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATP2B4P23634 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATP2B4P23634 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATP2B4P23634 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATP2B4P23634 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATP2B4P23634 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATP2B4P23634 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
ATP2B4P23634 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATP2B4P23634 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATP2B4P23634 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATP2B4P23634 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATP2B4P23634 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATP2B4P23634 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATP2B4P23634 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATP2B4P23634 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATP2B4P23634 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms