Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRZ1P23471 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRZ1P23471 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRZ1P23471 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRZ1P23471 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRZ1P23471 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRZ1P23471 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRZ1P23471 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRZ1P23471 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRZ1P23471 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRZ1P23471 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRZ1P23471 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRZ1P23471 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRZ1P23471 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRZ1P23471 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRZ1P23471 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRZ1P23471 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRZ1P23471 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRZ1P23471 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRZ1P23471 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRZ1P23471 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRZ1P23471 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRZ1P23471 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRZ1P23471 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRZ1P23471 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRZ1P23471 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRZ1P23471 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRZ1P23471 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRZ1P23471 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRZ1P23471 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRZ1P23471 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRZ1P23471 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRZ1P23471 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRZ1P23471 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRZ1P23471 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRZ1P23471 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRZ1P23471 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRZ1P23471 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRZ1P23471 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRZ1P23471 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRZ1P23471 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRZ1P23471 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRZ1P23471 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRZ1P23471 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRZ1P23471 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRZ1P23471 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRZ1P23471 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRZ1P23471 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRZ1P23471 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRZ1P23471 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRZ1P23471 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRZ1P23471 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRZ1P23471 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRZ1P23471 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRZ1P23471 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRZ1P23471 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRZ1P23471 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRZ1P23471 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRZ1P23471 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRZ1P23471 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRZ1P23471 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRZ1P23471 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRZ1P23471 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRZ1P23471 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRZ1P23471 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRZ1P23471 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRZ1P23471 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRZ1P23471 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRZ1P23471 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRZ1P23471 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRZ1P23471 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRZ1P23471 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRZ1P23471 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRZ1P23471 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRZ1P23471 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRZ1P23471 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRZ1P23471 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRZ1P23471 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRZ1P23471 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRZ1P23471 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRZ1P23471 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRZ1P23471 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRZ1P23471 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRZ1P23471 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRZ1P23471 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRZ1P23471 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRZ1P23471 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRZ1P23471 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRZ1P23471 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRZ1P23471 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRZ1P23471 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRZ1P23471 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRZ1P23471 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRZ1P23471 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRZ1P23471 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRZ1P23471 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRZ1P23471 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRZ1P23471 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRZ1P23471 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRZ1P23471 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms