Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHCGRP22888 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHCGRP22888 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHCGRP22888 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LHCGRP22888 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LHCGRP22888 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LHCGRP22888 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LHCGRP22888 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LHCGRP22888 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LHCGRP22888 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LHCGRP22888 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LHCGRP22888 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LHCGRP22888 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LHCGRP22888 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LHCGRP22888 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LHCGRP22888 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LHCGRP22888 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LHCGRP22888 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LHCGRP22888 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LHCGRP22888 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LHCGRP22888 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LHCGRP22888 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LHCGRP22888 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LHCGRP22888 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LHCGRP22888 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LHCGRP22888 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LHCGRP22888 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LHCGRP22888 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LHCGRP22888 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LHCGRP22888 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHCGRP22888 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHCGRP22888 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHCGRP22888 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHCGRP22888 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHCGRP22888 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHCGRP22888 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHCGRP22888 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHCGRP22888 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LHCGRP22888 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LHCGRP22888 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LHCGRP22888 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LHCGRP22888 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LHCGRP22888 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LHCGRP22888 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LHCGRP22888 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LHCGRP22888 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LHCGRP22888 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHCGRP22888 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHCGRP22888 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHCGRP22888 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHCGRP22888 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHCGRP22888 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LHCGRP22888 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LHCGRP22888 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LHCGRP22888 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LHCGRP22888 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LHCGRP22888 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LHCGRP22888 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LHCGRP22888 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LHCGRP22888 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHCGRP22888 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHCGRP22888 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHCGRP22888 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHCGRP22888 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHCGRP22888 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LHCGRP22888 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LHCGRP22888 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LHCGRP22888 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LHCGRP22888 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LHCGRP22888 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LHCGRP22888 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LHCGRP22888 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LHCGRP22888 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LHCGRP22888 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LHCGRP22888 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LHCGRP22888 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LHCGRP22888 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LHCGRP22888 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LHCGRP22888 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LHCGRP22888 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LHCGRP22888 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LHCGRP22888 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LHCGRP22888 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LHCGRP22888 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LHCGRP22888 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LHCGRP22888 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHCGRP22888 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHCGRP22888 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHCGRP22888 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHCGRP22888 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHCGRP22888 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHCGRP22888 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LHCGRP22888 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHCGRP22888 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHCGRP22888 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LHCGRP22888 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LHCGRP22888 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LHCGRP22888 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LHCGRP22888 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LHCGRP22888 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms