Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD53P19397 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD53P19397 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD53P19397 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD53P19397 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD53P19397 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD53P19397 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD53P19397 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CD53P19397 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD53P19397 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD53P19397 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD53P19397 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD53P19397 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD53P19397 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD53P19397 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD53P19397 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD53P19397 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD53P19397 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD53P19397 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD53P19397 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD53P19397 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD53P19397 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD53P19397 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD53P19397 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD53P19397 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD53P19397 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD53P19397 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD53P19397 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD53P19397 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD53P19397 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD53P19397 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD53P19397 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD53P19397 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD53P19397 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD53P19397 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD53P19397 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD53P19397 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD53P19397 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD53P19397 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD53P19397 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CD53P19397 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD53P19397 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD53P19397 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD53P19397 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CD53P19397 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD53P19397 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD53P19397 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD53P19397 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CD53P19397 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD53P19397 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD53P19397 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD53P19397 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD53P19397 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD53P19397 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD53P19397 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CD53P19397 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD53P19397 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CD53P19397 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CD53P19397 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CD53P19397 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CD53P19397 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CD53P19397 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CD53P19397 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CD53P19397 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD53P19397 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CD53P19397 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD53P19397 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD53P19397 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD53P19397 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD53P19397 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD53P19397 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD53P19397 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD53P19397 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD53P19397 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD53P19397 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD53P19397 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CD53P19397 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD53P19397 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD53P19397 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD53P19397 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD53P19397 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD53P19397 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD53P19397 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD53P19397 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD53P19397 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD53P19397 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD53P19397 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD53P19397 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD53P19397 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD53P19397 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD53P19397 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD53P19397 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CD53P19397 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD53P19397 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD53P19397 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD53P19397 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD53P19397 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD53P19397 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD53P19397 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD53P19397 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms