Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT15P19012 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT15P19012 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT15P19012 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT15P19012 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT15P19012 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT15P19012 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT15P19012 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT15P19012 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT15P19012 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT15P19012 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT15P19012 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT15P19012 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT15P19012 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT15P19012 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT15P19012 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT15P19012 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT15P19012 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT15P19012 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT15P19012 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT15P19012 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT15P19012 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT15P19012 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT15P19012 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT15P19012 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT15P19012 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT15P19012 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT15P19012 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT15P19012 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT15P19012 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT15P19012 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT15P19012 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT15P19012 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT15P19012 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT15P19012 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT15P19012 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT15P19012 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT15P19012 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT15P19012 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT15P19012 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT15P19012 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT15P19012 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT15P19012 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT15P19012 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT15P19012 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT15P19012 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT15P19012 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT15P19012 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT15P19012 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT15P19012 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT15P19012 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT15P19012 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT15P19012 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT15P19012 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT15P19012 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT15P19012 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT15P19012 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT15P19012 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT15P19012 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT15P19012 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT15P19012 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT15P19012 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT15P19012 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT15P19012 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT15P19012 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT15P19012 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT15P19012 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT15P19012 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT15P19012 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT15P19012 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT15P19012 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT15P19012 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT15P19012 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT15P19012 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT15P19012 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT15P19012 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT15P19012 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT15P19012 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT15P19012 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT15P19012 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT15P19012 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT15P19012 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT15P19012 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT15P19012 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT15P19012 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT15P19012 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT15P19012 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT15P19012 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT15P19012 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT15P19012 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT15P19012 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT15P19012 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT15P19012 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT15P19012 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT15P19012 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT15P19012 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT15P19012 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT15P19012 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT15P19012 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT15P19012 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms