Protein–RNA interactions for Protein: P17181

IFNAR1, Interferon alpha/beta receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNAR1P17181 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFNAR1P17181 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFNAR1P17181 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFNAR1P17181 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFNAR1P17181 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFNAR1P17181 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFNAR1P17181 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFNAR1P17181 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFNAR1P17181 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFNAR1P17181 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
IFNAR1P17181 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFNAR1P17181 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFNAR1P17181 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFNAR1P17181 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFNAR1P17181 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFNAR1P17181 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFNAR1P17181 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFNAR1P17181 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFNAR1P17181 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFNAR1P17181 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFNAR1P17181 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
IFNAR1P17181 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFNAR1P17181 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFNAR1P17181 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFNAR1P17181 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFNAR1P17181 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFNAR1P17181 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFNAR1P17181 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFNAR1P17181 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFNAR1P17181 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFNAR1P17181 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFNAR1P17181 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFNAR1P17181 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFNAR1P17181 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFNAR1P17181 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFNAR1P17181 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFNAR1P17181 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFNAR1P17181 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFNAR1P17181 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFNAR1P17181 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFNAR1P17181 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFNAR1P17181 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFNAR1P17181 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
IFNAR1P17181 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFNAR1P17181 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFNAR1P17181 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFNAR1P17181 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFNAR1P17181 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
IFNAR1P17181 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFNAR1P17181 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
IFNAR1P17181 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFNAR1P17181 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFNAR1P17181 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFNAR1P17181 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFNAR1P17181 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFNAR1P17181 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFNAR1P17181 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFNAR1P17181 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
IFNAR1P17181 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFNAR1P17181 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFNAR1P17181 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFNAR1P17181 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFNAR1P17181 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFNAR1P17181 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFNAR1P17181 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFNAR1P17181 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFNAR1P17181 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFNAR1P17181 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
IFNAR1P17181 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
IFNAR1P17181 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
IFNAR1P17181 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
IFNAR1P17181 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IFNAR1P17181 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
IFNAR1P17181 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFNAR1P17181 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFNAR1P17181 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFNAR1P17181 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFNAR1P17181 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFNAR1P17181 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFNAR1P17181 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFNAR1P17181 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFNAR1P17181 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFNAR1P17181 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFNAR1P17181 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFNAR1P17181 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFNAR1P17181 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IFNAR1P17181 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IFNAR1P17181 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
IFNAR1P17181 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IFNAR1P17181 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
IFNAR1P17181 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IFNAR1P17181 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IFNAR1P17181 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFNAR1P17181 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFNAR1P17181 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFNAR1P17181 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFNAR1P17181 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFNAR1P17181 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFNAR1P17181 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFNAR1P17181 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms