Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GCFC2P16383 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GCFC2P16383 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GCFC2P16383 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GCFC2P16383 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GCFC2P16383 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GCFC2P16383 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GCFC2P16383 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GCFC2P16383 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GCFC2P16383 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GCFC2P16383 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GCFC2P16383 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GCFC2P16383 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GCFC2P16383 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GCFC2P16383 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GCFC2P16383 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GCFC2P16383 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GCFC2P16383 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GCFC2P16383 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GCFC2P16383 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GCFC2P16383 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GCFC2P16383 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GCFC2P16383 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GCFC2P16383 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GCFC2P16383 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GCFC2P16383 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GCFC2P16383 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GCFC2P16383 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GCFC2P16383 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GCFC2P16383 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GCFC2P16383 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GCFC2P16383 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GCFC2P16383 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCFC2P16383 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCFC2P16383 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GCFC2P16383 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCFC2P16383 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCFC2P16383 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCFC2P16383 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCFC2P16383 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCFC2P16383 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GCFC2P16383 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCFC2P16383 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCFC2P16383 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCFC2P16383 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCFC2P16383 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCFC2P16383 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCFC2P16383 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCFC2P16383 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
GCFC2P16383 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GCFC2P16383 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GCFC2P16383 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GCFC2P16383 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GCFC2P16383 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
GCFC2P16383 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GCFC2P16383 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GCFC2P16383 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
GCFC2P16383 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GCFC2P16383 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GCFC2P16383 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GCFC2P16383 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GCFC2P16383 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GCFC2P16383 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GCFC2P16383 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GCFC2P16383 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GCFC2P16383 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GCFC2P16383 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GCFC2P16383 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GCFC2P16383 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GCFC2P16383 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GCFC2P16383 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GCFC2P16383 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
GCFC2P16383 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GCFC2P16383 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GCFC2P16383 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GCFC2P16383 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GCFC2P16383 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GCFC2P16383 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GCFC2P16383 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GCFC2P16383 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GCFC2P16383 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GCFC2P16383 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GCFC2P16383 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GCFC2P16383 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GCFC2P16383 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GCFC2P16383 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GCFC2P16383 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GCFC2P16383 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GCFC2P16383 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GCFC2P16383 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GCFC2P16383 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GCFC2P16383 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GCFC2P16383 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GCFC2P16383 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GCFC2P16383 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GCFC2P16383 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GCFC2P16383 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GCFC2P16383 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GCFC2P16383 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GCFC2P16383 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms