Protein–RNA interactions for Protein: P15927

RPA2, Replication protein A 32 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA2P15927 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
RPA2P15927 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPA2P15927 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPA2P15927 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RPA2P15927 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPA2P15927 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPA2P15927 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPA2P15927 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPA2P15927 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPA2P15927 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPA2P15927 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPA2P15927 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPA2P15927 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA2P15927 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA2P15927 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA2P15927 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA2P15927 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA2P15927 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA2P15927 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA2P15927 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA2P15927 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA2P15927 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPA2P15927 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA2P15927 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA2P15927 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA2P15927 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA2P15927 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA2P15927 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPA2P15927 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA2P15927 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA2P15927 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA2P15927 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA2P15927 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA2P15927 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA2P15927 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RPA2P15927 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPA2P15927 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPA2P15927 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPA2P15927 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPA2P15927 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPA2P15927 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPA2P15927 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPA2P15927 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPA2P15927 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPA2P15927 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPA2P15927 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPA2P15927 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPA2P15927 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPA2P15927 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPA2P15927 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA2P15927 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA2P15927 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA2P15927 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA2P15927 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA2P15927 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA2P15927 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA2P15927 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA2P15927 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA2P15927 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPA2P15927 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPA2P15927 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPA2P15927 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPA2P15927 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPA2P15927 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPA2P15927 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPA2P15927 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPA2P15927 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPA2P15927 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPA2P15927 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPA2P15927 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPA2P15927 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPA2P15927 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPA2P15927 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPA2P15927 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPA2P15927 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPA2P15927 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPA2P15927 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPA2P15927 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPA2P15927 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPA2P15927 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPA2P15927 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPA2P15927 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPA2P15927 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RPA2P15927 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPA2P15927 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPA2P15927 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RPA2P15927 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RPA2P15927 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPA2P15927 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPA2P15927 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPA2P15927 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPA2P15927 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPA2P15927 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPA2P15927 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPA2P15927 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPA2P15927 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPA2P15927 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RPA2P15927 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPA2P15927 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RPA2P15927 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms