Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXB1P14653 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB1P14653 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXB1P14653 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB1P14653 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB1P14653 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB1P14653 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB1P14653 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXB1P14653 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB1P14653 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB1P14653 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB1P14653 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB1P14653 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB1P14653 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB1P14653 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB1P14653 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB1P14653 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB1P14653 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB1P14653 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB1P14653 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB1P14653 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB1P14653 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB1P14653 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB1P14653 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB1P14653 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB1P14653 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB1P14653 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB1P14653 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB1P14653 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB1P14653 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB1P14653 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB1P14653 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB1P14653 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB1P14653 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB1P14653 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB1P14653 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB1P14653 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB1P14653 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB1P14653 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB1P14653 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB1P14653 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HOXB1P14653 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB1P14653 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB1P14653 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB1P14653 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB1P14653 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HOXB1P14653 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB1P14653 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB1P14653 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB1P14653 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB1P14653 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB1P14653 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB1P14653 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB1P14653 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB1P14653 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB1P14653 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB1P14653 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB1P14653 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB1P14653 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB1P14653 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB1P14653 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB1P14653 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOXB1P14653 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOXB1P14653 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB1P14653 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB1P14653 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB1P14653 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB1P14653 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB1P14653 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB1P14653 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB1P14653 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB1P14653 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB1P14653 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB1P14653 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB1P14653 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB1P14653 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB1P14653 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB1P14653 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXB1P14653 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HOXB1P14653 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXB1P14653 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXB1P14653 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXB1P14653 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXB1P14653 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HOXB1P14653 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB1P14653 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms