Protein–RNA interactions for Protein: P13674

P4HA1, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4HA1P13674 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
P4HA1P13674 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
P4HA1P13674 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
P4HA1P13674 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
P4HA1P13674 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
P4HA1P13674 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
P4HA1P13674 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
P4HA1P13674 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
P4HA1P13674 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
P4HA1P13674 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
P4HA1P13674 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
P4HA1P13674 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
P4HA1P13674 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
P4HA1P13674 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
P4HA1P13674 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
P4HA1P13674 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
P4HA1P13674 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
P4HA1P13674 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
P4HA1P13674 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
P4HA1P13674 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
P4HA1P13674 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
P4HA1P13674 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
P4HA1P13674 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
P4HA1P13674 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
P4HA1P13674 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
P4HA1P13674 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
P4HA1P13674 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
P4HA1P13674 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
P4HA1P13674 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
P4HA1P13674 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
P4HA1P13674 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
P4HA1P13674 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
P4HA1P13674 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
P4HA1P13674 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
P4HA1P13674 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
P4HA1P13674 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
P4HA1P13674 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
P4HA1P13674 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
P4HA1P13674 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
P4HA1P13674 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
P4HA1P13674 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
P4HA1P13674 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
P4HA1P13674 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
P4HA1P13674 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
P4HA1P13674 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
P4HA1P13674 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
P4HA1P13674 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
P4HA1P13674 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
P4HA1P13674 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
P4HA1P13674 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
P4HA1P13674 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
P4HA1P13674 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
P4HA1P13674 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
P4HA1P13674 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
P4HA1P13674 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
P4HA1P13674 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
P4HA1P13674 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
P4HA1P13674 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
P4HA1P13674 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
P4HA1P13674 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
P4HA1P13674 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
P4HA1P13674 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
P4HA1P13674 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
P4HA1P13674 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
P4HA1P13674 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
P4HA1P13674 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
P4HA1P13674 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
P4HA1P13674 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
P4HA1P13674 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
P4HA1P13674 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
P4HA1P13674 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
P4HA1P13674 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
P4HA1P13674 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
P4HA1P13674 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
P4HA1P13674 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
P4HA1P13674 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
P4HA1P13674 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
P4HA1P13674 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
P4HA1P13674 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
P4HA1P13674 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
P4HA1P13674 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
P4HA1P13674 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
P4HA1P13674 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
P4HA1P13674 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
P4HA1P13674 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
P4HA1P13674 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
P4HA1P13674 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
P4HA1P13674 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
P4HA1P13674 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
P4HA1P13674 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
P4HA1P13674 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
P4HA1P13674 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
P4HA1P13674 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
P4HA1P13674 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
P4HA1P13674 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
P4HA1P13674 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
P4HA1P13674 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
P4HA1P13674 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
P4HA1P13674 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
P4HA1P13674 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms