Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBL4AP11441 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBL4AP11441 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBL4AP11441 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBL4AP11441 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBL4AP11441 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBL4AP11441 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBL4AP11441 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBL4AP11441 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBL4AP11441 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBL4AP11441 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBL4AP11441 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBL4AP11441 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBL4AP11441 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBL4AP11441 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBL4AP11441 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBL4AP11441 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBL4AP11441 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBL4AP11441 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBL4AP11441 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBL4AP11441 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBL4AP11441 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBL4AP11441 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UBL4AP11441 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBL4AP11441 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBL4AP11441 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UBL4AP11441 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms