Protein–RNA interactions for Protein: P0DML3

CSH2, Chorionic somatomammotropin hormone 2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSH2P0DML3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CSH2P0DML3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSH2P0DML3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSH2P0DML3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSH2P0DML3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSH2P0DML3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSH2P0DML3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSH2P0DML3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSH2P0DML3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSH2P0DML3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSH2P0DML3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSH2P0DML3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSH2P0DML3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSH2P0DML3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSH2P0DML3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSH2P0DML3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSH2P0DML3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSH2P0DML3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CSH2P0DML3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSH2P0DML3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSH2P0DML3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSH2P0DML3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSH2P0DML3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSH2P0DML3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CSH2P0DML3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSH2P0DML3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSH2P0DML3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSH2P0DML3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSH2P0DML3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSH2P0DML3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSH2P0DML3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CSH2P0DML3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSH2P0DML3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSH2P0DML3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSH2P0DML3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSH2P0DML3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSH2P0DML3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSH2P0DML3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSH2P0DML3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSH2P0DML3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSH2P0DML3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSH2P0DML3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSH2P0DML3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSH2P0DML3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSH2P0DML3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSH2P0DML3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSH2P0DML3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSH2P0DML3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CSH2P0DML3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSH2P0DML3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSH2P0DML3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSH2P0DML3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSH2P0DML3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSH2P0DML3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSH2P0DML3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSH2P0DML3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CSH2P0DML3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CSH2P0DML3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CSH2P0DML3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSH2P0DML3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSH2P0DML3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSH2P0DML3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSH2P0DML3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSH2P0DML3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSH2P0DML3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSH2P0DML3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSH2P0DML3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSH2P0DML3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSH2P0DML3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSH2P0DML3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSH2P0DML3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSH2P0DML3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSH2P0DML3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSH2P0DML3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSH2P0DML3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSH2P0DML3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSH2P0DML3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSH2P0DML3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSH2P0DML3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CSH2P0DML3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSH2P0DML3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSH2P0DML3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSH2P0DML3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSH2P0DML3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CSH2P0DML3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSH2P0DML3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSH2P0DML3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSH2P0DML3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSH2P0DML3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSH2P0DML3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSH2P0DML3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CSH2P0DML3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSH2P0DML3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSH2P0DML3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSH2P0DML3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSH2P0DML3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSH2P0DML3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSH2P0DML3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSH2P0DML3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSH2P0DML3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms