Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C8orf88P0DMB2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C8orf88P0DMB2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C8orf88P0DMB2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms