Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC2BP0DI82 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC2BP0DI82 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRAPPC2BP0DI82 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRAPPC2BP0DI82 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC2BP0DI82 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC2BP0DI82 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC2BP0DI82 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC2BP0DI82 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC2BP0DI82 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC2BP0DI82 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC2BP0DI82 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC2BP0DI82 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC2BP0DI82 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC2BP0DI82 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms