Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
HOXB7P09629 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
HOXB7P09629 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
HOXB7P09629 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HOXB7P09629 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
HOXB7P09629 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
HOXB7P09629 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
HOXB7P09629 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
HOXB7P09629 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
HOXB7P09629 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
HOXB7P09629 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
HOXB7P09629 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
HOXB7P09629 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
HOXB7P09629 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
HOXB7P09629 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
HOXB7P09629 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
HOXB7P09629 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
HOXB7P09629 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
HOXB7P09629 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
HOXB7P09629 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
HOXB7P09629 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HOXB7P09629 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
HOXB7P09629 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
HOXB7P09629 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
HOXB7P09629 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
HOXB7P09629 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
HOXB7P09629 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
HOXB7P09629 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
HOXB7P09629 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
HOXB7P09629 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
HOXB7P09629 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
HOXB7P09629 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
HOXB7P09629 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
HOXB7P09629 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
HOXB7P09629 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
HOXB7P09629 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
HOXB7P09629 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
HOXB7P09629 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
HOXB7P09629 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HOXB7P09629 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HOXB7P09629 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
HOXB7P09629 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
HOXB7P09629 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
HOXB7P09629 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
HOXB7P09629 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
HOXB7P09629 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
HOXB7P09629 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
HOXB7P09629 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
HOXB7P09629 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
HOXB7P09629 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
HOXB7P09629 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
HOXB7P09629 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
HOXB7P09629 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
HOXB7P09629 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
HOXB7P09629 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
HOXB7P09629 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
HOXB7P09629 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
HOXB7P09629 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
HOXB7P09629 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
HOXB7P09629 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
HOXB7P09629 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
HOXB7P09629 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
HOXB7P09629 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
HOXB7P09629 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
HOXB7P09629 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
HOXB7P09629 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
HOXB7P09629 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
HOXB7P09629 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
HOXB7P09629 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
HOXB7P09629 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
HOXB7P09629 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
HOXB7P09629 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
HOXB7P09629 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
HOXB7P09629 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
HOXB7P09629 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
HOXB7P09629 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
HOXB7P09629 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
HOXB7P09629 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
HOXB7P09629 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
HOXB7P09629 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
HOXB7P09629 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
HOXB7P09629 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
HOXB7P09629 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
HOXB7P09629 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
HOXB7P09629 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HOXB7P09629 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HOXB7P09629 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HOXB7P09629 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HOXB7P09629 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HOXB7P09629 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
HOXB7P09629 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
HOXB7P09629 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
HOXB7P09629 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HOXB7P09629 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
HOXB7P09629 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
HOXB7P09629 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HOXB7P09629 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
HOXB7P09629 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
HOXB7P09629 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
HOXB7P09629 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms