Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLTAP09496 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLTAP09496 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CLTAP09496 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLTAP09496 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLTAP09496 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLTAP09496 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CLTAP09496 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLTAP09496 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLTAP09496 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLTAP09496 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLTAP09496 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLTAP09496 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CLTAP09496 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLTAP09496 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLTAP09496 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CLTAP09496 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLTAP09496 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLTAP09496 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLTAP09496 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLTAP09496 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLTAP09496 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLTAP09496 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLTAP09496 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
CLTAP09496 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLTAP09496 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CLTAP09496 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLTAP09496 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLTAP09496 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLTAP09496 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLTAP09496 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLTAP09496 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLTAP09496 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLTAP09496 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLTAP09496 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLTAP09496 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLTAP09496 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLTAP09496 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLTAP09496 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLTAP09496 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLTAP09496 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLTAP09496 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLTAP09496 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLTAP09496 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLTAP09496 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLTAP09496 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLTAP09496 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLTAP09496 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLTAP09496 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLTAP09496 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLTAP09496 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CLTAP09496 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLTAP09496 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLTAP09496 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLTAP09496 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLTAP09496 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLTAP09496 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLTAP09496 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLTAP09496 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLTAP09496 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLTAP09496 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLTAP09496 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLTAP09496 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLTAP09496 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CLTAP09496 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLTAP09496 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLTAP09496 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLTAP09496 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLTAP09496 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CLTAP09496 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLTAP09496 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLTAP09496 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLTAP09496 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLTAP09496 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLTAP09496 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLTAP09496 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLTAP09496 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLTAP09496 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLTAP09496 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLTAP09496 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLTAP09496 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLTAP09496 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLTAP09496 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLTAP09496 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLTAP09496 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLTAP09496 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLTAP09496 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLTAP09496 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CLTAP09496 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLTAP09496 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CLTAP09496 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLTAP09496 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLTAP09496 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLTAP09496 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLTAP09496 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLTAP09496 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLTAP09496 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLTAP09496 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLTAP09496 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLTAP09496 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms