Protein–RNA interactions for Protein: P08123

COL1A2, Collagen alpha-2(I) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL1A2P08123 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL1A2P08123 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL1A2P08123 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL1A2P08123 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL1A2P08123 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL1A2P08123 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL1A2P08123 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
COL1A2P08123 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL1A2P08123 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL1A2P08123 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL1A2P08123 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL1A2P08123 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL1A2P08123 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL1A2P08123 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
COL1A2P08123 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL1A2P08123 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL1A2P08123 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL1A2P08123 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL1A2P08123 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL1A2P08123 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL1A2P08123 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
COL1A2P08123 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL1A2P08123 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL1A2P08123 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL1A2P08123 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
COL1A2P08123 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL1A2P08123 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL1A2P08123 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL1A2P08123 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL1A2P08123 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL1A2P08123 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL1A2P08123 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL1A2P08123 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL1A2P08123 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL1A2P08123 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL1A2P08123 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL1A2P08123 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL1A2P08123 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL1A2P08123 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL1A2P08123 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL1A2P08123 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL1A2P08123 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL1A2P08123 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL1A2P08123 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
COL1A2P08123 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL1A2P08123 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
COL1A2P08123 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL1A2P08123 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL1A2P08123 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL1A2P08123 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL1A2P08123 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL1A2P08123 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL1A2P08123 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL1A2P08123 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL1A2P08123 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL1A2P08123 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL1A2P08123 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL1A2P08123 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL1A2P08123 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL1A2P08123 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL1A2P08123 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL1A2P08123 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL1A2P08123 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL1A2P08123 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.3 ms