Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOP08100 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOP08100 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOP08100 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOP08100 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOP08100 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOP08100 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOP08100 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHOP08100 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHOP08100 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHOP08100 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOP08100 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOP08100 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOP08100 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOP08100 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOP08100 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHOP08100 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RHOP08100 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHOP08100 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHOP08100 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RHOP08100 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHOP08100 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHOP08100 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHOP08100 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHOP08100 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHOP08100 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHOP08100 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHOP08100 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHOP08100 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHOP08100 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHOP08100 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RHOP08100 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHOP08100 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOP08100 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOP08100 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOP08100 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOP08100 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOP08100 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOP08100 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOP08100 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOP08100 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOP08100 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOP08100 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOP08100 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHOP08100 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHOP08100 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHOP08100 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHOP08100 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHOP08100 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOP08100 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOP08100 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOP08100 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOP08100 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOP08100 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOP08100 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHOP08100 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHOP08100 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RHOP08100 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RHOP08100 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHOP08100 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHOP08100 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHOP08100 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHOP08100 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHOP08100 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOP08100 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOP08100 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOP08100 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOP08100 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOP08100 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOP08100 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOP08100 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOP08100 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOP08100 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOP08100 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOP08100 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHOP08100 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHOP08100 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHOP08100 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RHOP08100 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RHOP08100 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RHOP08100 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RHOP08100 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RHOP08100 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RHOP08100 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHOP08100 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RHOP08100 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RHOP08100 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHOP08100 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHOP08100 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHOP08100 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHOP08100 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHOP08100 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHOP08100 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHOP08100 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHOP08100 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHOP08100 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHOP08100 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHOP08100 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHOP08100 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHOP08100 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms