Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTMAP06454 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTMAP06454 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTMAP06454 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTMAP06454 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTMAP06454 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTMAP06454 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTMAP06454 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTMAP06454 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTMAP06454 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PTMAP06454 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTMAP06454 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTMAP06454 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTMAP06454 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTMAP06454 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTMAP06454 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTMAP06454 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTMAP06454 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTMAP06454 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTMAP06454 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTMAP06454 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTMAP06454 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTMAP06454 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTMAP06454 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTMAP06454 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTMAP06454 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTMAP06454 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTMAP06454 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTMAP06454 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTMAP06454 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTMAP06454 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTMAP06454 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTMAP06454 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTMAP06454 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTMAP06454 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTMAP06454 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTMAP06454 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PTMAP06454 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTMAP06454 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTMAP06454 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTMAP06454 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTMAP06454 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTMAP06454 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTMAP06454 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTMAP06454 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTMAP06454 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTMAP06454 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTMAP06454 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTMAP06454 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTMAP06454 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTMAP06454 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTMAP06454 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTMAP06454 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTMAP06454 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTMAP06454 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTMAP06454 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTMAP06454 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTMAP06454 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTMAP06454 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTMAP06454 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTMAP06454 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTMAP06454 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTMAP06454 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTMAP06454 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTMAP06454 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTMAP06454 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTMAP06454 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTMAP06454 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTMAP06454 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTMAP06454 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTMAP06454 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTMAP06454 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PTMAP06454 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTMAP06454 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTMAP06454 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTMAP06454 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTMAP06454 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PTMAP06454 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTMAP06454 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTMAP06454 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTMAP06454 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTMAP06454 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTMAP06454 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTMAP06454 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTMAP06454 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTMAP06454 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTMAP06454 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTMAP06454 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTMAP06454 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTMAP06454 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTMAP06454 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTMAP06454 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTMAP06454 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTMAP06454 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PTMAP06454 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTMAP06454 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTMAP06454 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTMAP06454 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTMAP06454 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTMAP06454 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms