Protein–RNA interactions for Protein: P05556

ITGB1, Integrin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1P05556 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGB1P05556 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGB1P05556 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGB1P05556 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGB1P05556 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGB1P05556 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGB1P05556 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGB1P05556 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGB1P05556 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGB1P05556 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGB1P05556 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGB1P05556 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGB1P05556 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGB1P05556 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGB1P05556 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGB1P05556 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGB1P05556 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGB1P05556 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGB1P05556 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGB1P05556 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGB1P05556 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGB1P05556 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGB1P05556 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGB1P05556 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGB1P05556 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGB1P05556 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGB1P05556 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGB1P05556 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGB1P05556 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGB1P05556 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGB1P05556 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGB1P05556 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGB1P05556 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGB1P05556 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGB1P05556 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGB1P05556 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGB1P05556 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGB1P05556 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGB1P05556 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGB1P05556 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGB1P05556 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGB1P05556 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGB1P05556 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGB1P05556 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGB1P05556 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ITGB1P05556 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGB1P05556 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGB1P05556 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGB1P05556 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGB1P05556 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGB1P05556 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGB1P05556 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGB1P05556 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGB1P05556 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGB1P05556 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGB1P05556 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGB1P05556 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGB1P05556 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGB1P05556 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGB1P05556 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGB1P05556 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGB1P05556 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGB1P05556 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGB1P05556 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGB1P05556 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGB1P05556 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGB1P05556 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGB1P05556 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGB1P05556 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGB1P05556 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGB1P05556 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGB1P05556 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGB1P05556 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB1P05556 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB1P05556 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB1P05556 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB1P05556 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB1P05556 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB1P05556 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB1P05556 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ITGB1P05556 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGB1P05556 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGB1P05556 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGB1P05556 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGB1P05556 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGB1P05556 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGB1P05556 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGB1P05556 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGB1P05556 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGB1P05556 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGB1P05556 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGB1P05556 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGB1P05556 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGB1P05556 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGB1P05556 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB1P05556 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB1P05556 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB1P05556 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB1P05556 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB1P05556 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms