Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERPIND1P05546 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERPIND1P05546 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERPIND1P05546 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERPIND1P05546 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERPIND1P05546 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SERPIND1P05546 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SERPIND1P05546 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SERPIND1P05546 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SERPIND1P05546 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SERPIND1P05546 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERPIND1P05546 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERPIND1P05546 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERPIND1P05546 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERPIND1P05546 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERPIND1P05546 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SERPIND1P05546 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SERPIND1P05546 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SERPIND1P05546 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SERPIND1P05546 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SERPIND1P05546 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SERPIND1P05546 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SERPIND1P05546 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SERPIND1P05546 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SERPIND1P05546 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SERPIND1P05546 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SERPIND1P05546 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SERPIND1P05546 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SERPIND1P05546 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SERPIND1P05546 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERPIND1P05546 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERPIND1P05546 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERPIND1P05546 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERPIND1P05546 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERPIND1P05546 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERPIND1P05546 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SERPIND1P05546 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERPIND1P05546 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERPIND1P05546 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERPIND1P05546 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERPIND1P05546 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERPIND1P05546 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERPIND1P05546 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERPIND1P05546 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERPIND1P05546 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERPIND1P05546 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERPIND1P05546 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERPIND1P05546 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERPIND1P05546 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERPIND1P05546 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERPIND1P05546 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERPIND1P05546 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERPIND1P05546 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SERPIND1P05546 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SERPIND1P05546 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SERPIND1P05546 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERPIND1P05546 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERPIND1P05546 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERPIND1P05546 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERPIND1P05546 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERPIND1P05546 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SERPIND1P05546 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERPIND1P05546 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SERPIND1P05546 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERPIND1P05546 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERPIND1P05546 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERPIND1P05546 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERPIND1P05546 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERPIND1P05546 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERPIND1P05546 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERPIND1P05546 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERPIND1P05546 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERPIND1P05546 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERPIND1P05546 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERPIND1P05546 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERPIND1P05546 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERPIND1P05546 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERPIND1P05546 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERPIND1P05546 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SERPIND1P05546 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERPIND1P05546 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERPIND1P05546 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERPIND1P05546 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERPIND1P05546 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERPIND1P05546 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SERPIND1P05546 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERPIND1P05546 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERPIND1P05546 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERPIND1P05546 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERPIND1P05546 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERPIND1P05546 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERPIND1P05546 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERPIND1P05546 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERPIND1P05546 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERPIND1P05546 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SERPIND1P05546 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERPIND1P05546 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERPIND1P05546 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERPIND1P05546 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERPIND1P05546 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms