Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
COL2A1P02458 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29■■■□□ 2.23
COL2A1P02458 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
COL2A1P02458 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
COL2A1P02458 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL2A1P02458 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL2A1P02458 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL2A1P02458 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL2A1P02458 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL2A1P02458 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL2A1P02458 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL2A1P02458 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL2A1P02458 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL2A1P02458 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL2A1P02458 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL2A1P02458 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL2A1P02458 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL2A1P02458 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL2A1P02458 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL2A1P02458 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
COL2A1P02458 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
COL2A1P02458 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
COL2A1P02458 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
COL2A1P02458 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL2A1P02458 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL2A1P02458 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
COL2A1P02458 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL2A1P02458 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL2A1P02458 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL2A1P02458 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL2A1P02458 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL2A1P02458 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL2A1P02458 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL2A1P02458 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL2A1P02458 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL2A1P02458 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL2A1P02458 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL2A1P02458 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL2A1P02458 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL2A1P02458 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL2A1P02458 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL2A1P02458 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL2A1P02458 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL2A1P02458 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL2A1P02458 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL2A1P02458 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
COL2A1P02458 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
COL2A1P02458 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL2A1P02458 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL2A1P02458 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL2A1P02458 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL2A1P02458 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL2A1P02458 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL2A1P02458 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL2A1P02458 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
COL2A1P02458 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL2A1P02458 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL2A1P02458 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL2A1P02458 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL2A1P02458 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL2A1P02458 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL2A1P02458 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL2A1P02458 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL2A1P02458 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL2A1P02458 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL2A1P02458 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL2A1P02458 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL2A1P02458 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
COL2A1P02458 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL2A1P02458 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL2A1P02458 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL2A1P02458 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COL2A1P02458 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COL2A1P02458 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COL2A1P02458 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COL2A1P02458 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
COL2A1P02458 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
COL2A1P02458 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
COL2A1P02458 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
COL2A1P02458 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL2A1P02458 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
COL2A1P02458 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL2A1P02458 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL2A1P02458 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL2A1P02458 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL2A1P02458 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL2A1P02458 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL2A1P02458 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
COL2A1P02458 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COL2A1P02458 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COL2A1P02458 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COL2A1P02458 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
COL2A1P02458 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COL2A1P02458 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL2A1P02458 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL2A1P02458 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL2A1P02458 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL2A1P02458 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
COL2A1P02458 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL2A1P02458 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms